学院承担四个专业方向的专业课课程、全校各专业研究生、非计算机类本专科学生及成人教育学院的计算机课程教学，全院每年平均理论课程教学任务6000多标准课时，上机实验课程教学任务约7000标准课时，合计13000多标准课时。学院每学年组织并承担四次全国高等学校计算机水平考试及全国计算机等级考试。
学院十分重视教材建设，医药信息工程学院教师已主编规划教材及编写论著11部，其中国家级规划教材2部；副主编规划教材9部。学院积极组建专业水平较高、思路活跃的教师团队参加国家级、省部级科研项目的科研申报工作，参加教学质量工程建设项目。现有省部级在研课题2项，省教育厅在研课题4项，校级在研课题7项。
护理学院
安徽中医药大学护理学专业创办于1990年，是全国高等中医院校中较早开设护理专业的院校之一。2002年护理学院增招了美容医学专业。
护理学院下设四个科级建制（办公室、教学、实习、团总支）、三个教研室（护理学教研室、中医护理学教研室、美容医学教研室）和一个实验教学中心，两所附属医院下设护理临床教研室。同时拥有一支结构合理、生机勃勃的师资队伍，有专兼职教师30余人，其中教授、副教授6人。承担科研课题10余项，主编、参编统编教材等各级各类教材10余部。
护理学院现设护理学及中西医临床医学（美容医学方向）两大专业，其专业层次及方向包括：护理学本科、护理学本科（涉外护理方向）、护理学专升本、护理学专科及中西医临床（美容医学方向）本科。护理学院共培养毕业生近两千人，每年就业率均在100%，除部分学生继续攻读研究生以及在日本、瑞典学习就业外，绝大多数在国内省、市级医院及医学院校工作，受到用人单位的一致好评，其中不少已成为省内外护理专业和美容专业临床、教学及管理中的骨干力量。
护理学专业拥有多个实力雄厚的高水准实习基地：安徽省立医院、上海曙光医院、上海龙华医院、浙江省中医院、合肥市第一人民医院、北京广安门医院、安徽中医药大学第一、第二附属医院、芜湖弋矶山医院等，保证了学生临床见习和实习教学质量，并在部分医院实现了实习—就业一体化。
学院致力于构建全方位开放式办学格局，对外交流呈现出十分活跃的局面。以社会需求和学生就业取向为切入点，旨在培养具备人文社会科学、医学、预防保健的基本知识及护理学的基本理论知识和技能，能在护理领域内从事临床护理、预防保健、护理管理、护理教学和护理科研的高级专门人才。本着“注重整体，突出护理，加强人文，体现教育”的原则，狠抓学科和专业建设，加大对外交流与合作，为学生搭建国内外就业的平台。首批在日本工作的学生，生活工作状况良好，开创了护理学专业国际化就业的新局面。在长期和广泛的国际合作与交流中，护理学院逐步与国际护理教育接轨。