多年来，基础医学院始终坚持以教学和科研为中心的指导思想，重视师资培养及学科建设，坚持教学、科研相结合，广泛开展教学改革和科学研究，并取得了较好成绩。九八年以来，获教学成果奖21项，承担国家级、省部级科研项目30项，在国际学术刊物上发表论文50余篇，国内学术刊物上发表论文800余篇，出版各种专著、教材、译著50部，参编全国高等院校教材18部。本部门历任领导班子都十分重视教职工职业道德教育，制定有完备的职业道德规范和行之有效的规章制度，这些都成为广大教师日常工作的行为规范。教师热爱本职，甘为人梯，为人师表，默默奉献，在教书育人、科技开发及其他各类活动中表现突出，原基础部1999年获甘肃省思想政治工作先进集体；党总支2001年获甘肃省党的建设优秀基层单位 ，2003年8月，基础医学院获甘肃省工会“模范职工之家”荣誉称号：“五一”劳动奖章获得者1人；省级优秀专家3人；全国优秀教师1人；享受国务院政府津贴专家11人；甘肃省“333、555”人才工程第一、二层次人员8人；省级跨世纪学科带头人5人；省园丁奖获得者3人；省青年教师成才奖获得者4人；全国高校科技先进工作者1人；全国先进教育工作者1人。
并入兰州大学后，全院师生员工正以 开拓创新、引领未来、教学科研争创一流的精神；力足西北，面向全国；在工作中以人为本，质量优先；决心把学院建设成一个充满生机与活力、具有鲜明办学特色的二级学院。