第四届中国高校特色科技期刊奖
连续五届新疆期刊奖和全国优秀科技期刊三等奖（政府奖）
本刊先后7次荣获新疆维吾尔自治区科技期刊质量评比一等奖
2004荣获由中国家学会评选的第四届全国优秀农业期刊学术类二等奖
7、偏重的研究方向：
生命科学、农学基础与作物学、作物栽培与耕作学
新疆农业科学杂志主要栏目：
作物育种与栽培、植物保护、土壤肥料、园艺特产、林业、畜牧业、生物技术
新疆农业科学杂志社已发表论文目录：
玉米ZmPsaH基因真核表达载体的构建及转化刘小利;郝晓燕;陈勋基;陈果;足木热木;邵琳;黄全生
棉花GhGGPase基因克隆、序列分析及原核表达禄亚洲;赛富涛;李榕;李鸿彬
籽瓜氮、磷、钾肥料效应的研究李承业;林明;潘竟海;白晓山;刘华君
几种杀菌剂对水稻稻瘟病的防治效果王锁牢;李广阔;高海峰;吴强;郝安平
棉花新陆早17号愈伤组织中盐响应相关基因的表达分析廖茂森;何金燕;张富春
外源松柏醛、芥子醛对离体培养棉纤维生长发育的影响杨家平;杨洋;王玉晶;范玲
玉米ZmCIPK42原核表达载体构建及蛋白纯化陈勋基;陈果;黄全生
新疆核桃8个天然群体遗传多样性的SSR评价曾斌;田嘉;李疆
低温胁迫对扁桃休眠枝条电解质渗出率的影响蒋江照;王建友;毛金梅;邱杰;廖康
库尔勒香梨冬季树冠内微气候变化规律研究成小龙;廖康;李楠;刘娟;赵世荣;马媛;孙琪
低温胁迫对三种早春短命植物生理生化指标的影响李彦奇;姚正培;张桦;代培红
蟠桃磷脂酶D基因RNAi表达载体构建史元敏;何天明;袁海英
阿拉尔垦区不同栽培密度下骏枣果实外观色度的比较杨伟;刘秀印;唐都;李湘钰;高疆生
干旱区套袋红富士苹果的品质特征研究王娜;李建贵
新疆春小麦种质资源农艺性状和品质性状的遗传多样性分析王小国;梁红艳;张薇
不同栽培措施对新疆灰枣一年生枣头枝抗寒力的影响潘俨;车凤斌;郑素慧;张婷;胡柏文
络合型硼肥对棉花增产效应的研究张君;危常州;王肖娟;闵伟;李美宁
新疆灰枣一年生枣头枝抗寒力测定分析潘俨;车凤斌;郑素慧;张婷;胡柏文
大麦叶片表皮蜡质含量与抗旱性的关系研究张海禄;齐军仓
棉花种植密度与产量形成的关系邓福军;林海;宿俊吉;韩焕勇
杏花粉活力测定培养基筛选及耐贮性研究安晓芹;王玲丽;逯东阳;孙慧瑛;廖康
花花柴组织培养与植株再生体系的优化乃比江·麦图荪;张霞;张富春