【虾夷海胆】虾夷马粪海胆溶菌酶基因SNP标记的开发及多态性分析

时间:2016-11-24 09:24:11 作者:丛晓霏;丁君;常亚青

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【摘要】:采用高分辨率熔解曲线分析技术(HRM)对虾夷马粪海胆溶菌酶基因进行突变扫描,筛选出26个SNP候选位点。其中,碱基置换类型位点16个,占位点总数的61.54%;碱基插入或缺失的位点6个,缺失的碱基数为1~4个不等,占位点总数的23.08%;碱基置换类型模糊以及三态位点4个,占位点总数的15.38%。SNP在虾夷马粪海胆溶菌酶基因的cDNA中的分布频率约为2.85%,位于编码区的位点有18个,其中2个为错义突变。应用小扩增子基因分型法对5个SNP位点在2个不同地域群体的60个样本中进行分型分析,结果显示:5个SNP位点均含有2个等位基因,次等位基因频率分布范围为0.1500~0.5000,位点SILyz-7、SILyz-15和SILyz-20在两个群体间的次等位基因频率相差较大。研究结果表明,HRM是一种高效便捷的SNP分析方法,所筛选出的SNP标记可用于虾夷马粪海胆遗传育种的研究。
【论文正文预览】:虾夷马粪海胆(Strongylocentrotusintermedius)分布于日本北海道及以北沿海,俄罗斯远东地区的萨哈林岛等地,1989年由大连海洋大学水产与生命学院自日本引进,目前已成为中国北方沿海特别是辽东和山东半岛养殖的重要种类[1]。近年来,随着养殖规模的不断扩大,虾夷马粪海胆的病
【文章分类号】:S917.4
【稿件关键词】:虾夷马粪海胆溶菌酶高分辨率熔解曲线分析SNP
【参考文献】:
【稿件标题】:【虾夷海胆】虾夷马粪海胆溶菌酶基因SNP标记的开发及多态性分析
【作者单位】:大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室;
【发表期刊期数】:《中国农业科技导报》2012年05期
【期刊简介】:《中国农业科技导报》杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀期刊,中国农业科技导报杂志具有正规的双刊号,其中国内统一刊号:CN11-3900/S,国际刊号:ISSN1008-0864。中国农业科技导报杂志社由科学技术部主管、主办,本刊为刊。自创刊......更多中国农业科技导报杂志社(http://www.400qikan.com/qk/5942/)投稿信息
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