【蛋白质序列】蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用

时间：2015-04-17 11:22:39 作者：贾美多；杨闫；张盈盈

本文作者：贾美多；杨闫；张盈盈；李春；成功正常投稿发表论文到《浙江农业学报》2014年06期,引用请注明来源400期刊网！

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【摘要】：基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
【论文正文预览】：生物序列分析是生物信息学的主要研究领域,常常通过比较分析获取有用的信息。传统的序列比较方法是序列比对[1-2],但是利用比对的序列比较假设了同源片段之间是邻接保守的,这和遗传重组相冲突,而且多序列比对在计算复杂性等方面存在困难,这些使得人们致力于研究无比对的序列比
【文章分类号】：Q51
【稿件关键词】：-字母分类模型维向量系统发生分析
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【稿件标题】：【蛋白质序列】蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
【作者单位】：渤海大学数理学院;
【发表期刊期数】：《浙江农业学报》2014年06期
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