北京大学药学院是全国重点药学院（系）之一，也是国家最早建立的高等药学院校之一，其前身是北京大学中药研究所，始建于1941年。在此基础上，1943年建立北京大学医学院药学系；1952年医学院独立建院，随之改名为北京医学院药学系；1985年随学校更名为北京医科大学药学院；2000年4月更名为北京大学药学院。曾设本草医学|教育网搜集整理、制药、药学、药检、药物化学、生药学、应用化学（医药）、药理学等专业，现设药学专业（六年制本硕连读）。药学专业于2007、2008年被批准为国家级、北京市级高等学校特色专业建设点，于2008年被批准为“国家理科基础科学研究和教学人才培养基地”（简称理科基地）药学专业点。北京大学药学院是一个以培养研究型人才为目标的药学院。