北京中医药大学东直门医院中医内科学1989年被批准为国家级重点学科，在中医内科学术界处于领先地位，是历届全国中医内科学会的主任委员单位。中医内科学课程2005年被评为北京市精品课程。21世纪课程教材《中医内科学》、新世纪教材《中医外科学》2005年被评为北京市精品教材，《中医内科学》2006年还获得卫生部医药类优秀教材一等奖。另外，由我院专家担任主任委员、副主任委员的各级学会有59个。北京中医药大学第一临床医学院名师名家荟萃、人才辈出，涌现出董建华、王永炎两位中国工程院院士。
我国著名的中医学家和中医教育家秦伯未、于道济、单玉堂、胡希恕、肖友山、马龙伯、刘寿山、宋向元等开拓性地创建了中医学院附属医院的临床与教学相结合的模式，王子瑜、许连霈、金起凤、施汉章、刘弼臣、姜楫君、杨甲三、殷凤礼、印会河、焦树德、王孝常、廖家祯等中医前辈为中医药事业的传承与发扬奠定了坚实的基础。在老一辈中医学家的培养和带动下，我院又涌现出多名中青年学术骨干，其中教育部“长江学者奖励计划”特聘教授1名，人事部“百千万人才工程”国家级人选1名，北京市“教学名师奖”1名，北京市优秀教师2名，教育部“高校骨干教师”2名， “突出贡献中青年专家”2名，北京市首届群众喜爱的中青年名中医2名，“突发公共卫生事件国家级专家”3名，“北京市科技新星”2名，享受政府特殊津贴专家23名，北京市中青年骨干教师23名。这些成就为我院可持续发展打下了坚实的基础。