医科院基础医学研究所文革后：
1978年经国务院批准，原实研所迁回北京，因原址已另有所用，遂全部安置在当时大部闲空的东单三条五号医科大学大楼，与基础医学组原协和医大教学人员合在一起，更名为基础医学研究所。
翌年，黄家驷院长又奋力争取协和医大经上级批准复校，通过多方努力，克服重重主客观上的困难，医预科与北京大学生物系合作，本科利用原来实研所和医大共有的空间，以这两部分的人员、设备和工作为基础，有分有合地完成教学和研究双重任务。通过相互磨合，1982年基础所和医大的基础部（1993年称基础医学院）正式成为双名一体的机构，基本按学系/教研室建制，由郭福芝任所长，郭少军为党委书记，资深和中年骨干分别担任系/室领导职务，如谢少文、何观清、梁植权、李士谔、金荫昌、薛社普、王世中、高润泉、张秉常、罗会元、佘铭鹏、王振纲、吴冠芸、王琳芳、王德修、吴安然、陈孟勤、陆钟琦、潘华珍、刘尔翔、陈华粹、薛全福、李昆、杨子彬等，他们大都是在老协和工作过的人医|学教育网整理。1982年还任命当时基础所所长刘士廉（原协和医学院1953届毕业生）兼任医大教务长，副所长佘铭鹏（原协和医学院病理系讲师）兼任医大基础部主任，从而确保了八年制医大第三次复校（1985年称中国协和医科大学）的顺利进行和基础所的迅速恢复和发展；体制延续，以迄于今。基础医学研究所和基础医学院的沿革，概括起来就是原北京协和医学院临床前期机构的变迁和发展史。