首先是围绕问题收集资料和研究资料，虽然在课题研究或临床观察之前，已对有关资料和学术动态进行了搜集和分析，但是在撰写科研论文时仍要查阅大量有关文献，以作为对已掌握的文献的补充、有人作过统计，国内外多数科学工作者查阅文献的时间约占整个科研工作的三分之一，如果没有这些最新的参考文献，要想使论文达到新颖和独创性是不可能的。由此可见，查阅搜集文献在整个科研和写作过程中的重要性及必要性。
搜集资料的目的，是为撰写论文开拓思路，提供理论依据。医'学教育网|整理因此在搜集资料时，应根据论文的需要，把与科研课题有密切关系并要引用的资料做好卡片，注明文献的出处、作者、题目、杂志名称、卷、期、页数、年代等，漏一不可。否则等到文章写好后，注明参考文献时才发现缺少项目，又得重新查找，白白浪费时间。
一般搜集资料分三步法：①根据研究课题选择检索工具；②确定检索方法；③查阅原始文献。搜集论文需要的文献资料应特别注意以下几方面的内容：①在方法上沿用前人的，或在前人的基础上加以改进的；②在理论认识上支持本文观点的；③前人研究的结论与自己文章所述不同，需要加以说明的；④前人对本文所研究的问题存在争议和正在探讨的。将这些资料搜集好后，编好序号，以备撰写文章时使用。
其次是对研究材料的准备工作，它包括对材料的取舍和整理，对实验观察数据资料的分析处理，合理选用适当的图、表和照片等等。这部分工作有时在试验结果分析时已经完成。
第三是提炼观点，明确结果，提出结论。在上述准备工作完成以后，要根据有关文献资料和实验观察所得的资料，重新核对试验设计中所包含的思想，运用辨证唯物主义的观点，分析一下设计中哪些观点在理论上成立，而在试验中得到证实；哪些观点在试验中没有得到证实或未完全证实，需要修改；哪些现象和指标超出原来设想，而且可能有新的启示，需要进行新的分析。通过对试验材料的分析，提炼出试验材料能说明的观点和能得到的结果，提出结论，使试验材料和理论认识充分结合起来。
通过以上的准备工作，使理论和实践达到充分的统一，从而提高论文的水平。