医学院设在井冈山大学医学校区。校区座落在吉安市城区，交通十分便利。学院现设基础医学部、临床医学系、中医学系、口腔医学系和药学系，现有临床医学（本科、专科）、药学（本科、专科）、中医学（本科、专科）及口腔医学（本科、专科）四个专业，全日制在校学生1893人，来自全国30个省市自治区。另有留学生192人。
学院师资力量雄厚，全院教职工157人，其中博士10人，在读博士4人，硕士39人，在读硕士17人；正高职称18人，副高职称40人，其中省级名师1人，省中青年骨干教师3人，省“百千万人才工程”1人，校级学术带头人5人，兼职硕士研究生导师3人。
学院教学科研基础厚实，现有校重点建设一级学科1个（临床医学），校重点二级学科1个（循证医学），校重点建设二级学科4个（内科学、外科学、病理与生理学、生药学），校一般扶持学科3个（流行病与卫生统计学、法医学、肿瘤学），校实验示范中心1个（基础医学实验教学示范中心），校课程群1个（系统解剖学等），校教学团队1个（系统解剖学团队），校双语教学示范课程2门（系统解剖学及中医诊断学），学生创新实验项目4项。拥有中国循证教育部网上合作研究井冈山大学分中心、吉安市医药生物技术重点实验室和吉安市医疗纠纷争议尸验中心。2009年获国家自然科学基金2项。近五年来，省部级科技项目10项，省级教学改革课题30余项，市级科技课题20余项。教师发表学术论文600余篇，其中核心论文160余篇，出版著作、教材20余部，市厅级科技进步奖10余项。设有基础医学实验中心、临床医学实验室、药学实验室、口腔医学实验室、中医实验室和中医中药标本陈列室、解剖标本陈列室、中草药植物园。装备了生物安全柜、气相色谱仪、凝胶成像分析系统、微型台式高速冷冻离心机等一批供科研、教学使用的仪器设备。
附属医院为三等甲级医院，设备精良，技术力量雄厚。医'学教育网|整理教学医院、实习医院80余所，总床位数25154张。
我院办学思路是：坚持科学发展观，弘扬井冈山精神，以学科建设为龙头，以人才培养为核心，注重培养学生实践能力和创新能力，不断提高学生的综合素质与竞争能力，坚持教学、科研全面发展，不断提高教育教学质量。
目前，全院师生在学校党委、行政的领导下，正以全新的面貌和饱满的热情，为创办特色鲜明、人民满意的综合性大学医学院而努力奋斗。
临床医学专业（理工类；本科；学制五年；授医学学士学位）
培养德智体美劳全面发展的，掌握扎实的医学基本理论知识和熟练的实践技能，具有从事临床医疗医学专门人才。