厦门中山医院肝胆外科科研方面：
我科科研成果斐然。拥有临床实验室2个医学|教育网|搜集整理，建科以来先后有“肝脏的微环境与肝癌发生发展及预防的关系”，“干细胞诱导胰岛移植细胞免疫耐受的研究”，“肝癌转移相关基因研究”、“局部内放射治疗肝癌的研究”、“预防肝癌术后复发的研究” 、“肝癌的EGF，TNF-α，TGF-β1和VEGF基因多态性研究”，“骨髓干细胞移植诱导肝移植术后免疫耐受”、“肝脏干细胞的基础研究”等多个科研项目获国家自然科学基金、教育部及人事部留学回国人员基金、福建省自然科学基金、福建省卫生厅、市科技局、市卫生局科研资助。近年来我科医护人员在国家级学术刊物上共发表了100余篇论文，其中被国际权威杂志索引（SCI）收录的文章有20余篇，获得福建省科技进步三等奖一项，厦门市科技进步二等奖两项，三等奖一项，福建省自然科学优秀论文二等奖一项。现有在研科研项目20余项，仅2008年就获得包括国家自然科学基金在内的6项基金资助、研究经费约600万元（含配套），培养了研究生12名。显示了我科强大的创新力。我科还与美国匹兹堡大学移植中心，克里夫兰临床医学中心，以及德国、瑞典等国的医学中心建立了长期合作关系，共同开展肝移植、原发性肝癌等方面的临床应用研究。
肝胆外科承担多项国家及省市基础和临床科研项目，并利用研究成果为病员服务，已形成学科优势。临床广泛应用的危重抢救技术，娴熟应用各项临床营养技术包括全胃肠道外营养和肠内营养等已大大提高了各类肝胆胰疾病的治疗效果，降低了死亡率，特别在提高肝癌、肝门区胆管癌、胰腺癌、胆肠结合部肿瘤切除率及长期生存和生活质量方面取得了长足进步，达到国内领先水平。一批研究成果引起国内外专家的重视，有望进一步造福广大病患。实现科研究服务临床的宗旨。