昆山市第一人民医院的前身是广仁医院医学|教育网|搜集整理，诞生于明嘉靖年间半茧园遗址内，由地方集资、红十字会主办。1935年发展成为较具规模的西医医院，1946年成立公医院；1949年，由人民政府接管后改为昆山县人民医院，至1989年昆山撤县建市时，昆山县人民医院正式改称为昆山市第一人民医院。
1995年，医院顺利通过了国家卫生部的二级甲等医院的评审。2001年，成为江苏大学附属医院。2003年，通过ISO9001：2000质量体系认证。2004年，成为江苏省首批基本现代化医院。近年来，医院与上海华山医院、中山医院、上海市儿童医院等国内知名三甲医院成立技术合作中心，2007年与法国巴黎FRANCILIER南方中心医院缔结为友好医院，2009年获得“全国卫生系统先进集体”称号，2010年获得“全国院务公开示范点”称号，2011年与澳大利亚悉尼大学医学院附属内皮恩医院缔结友好医院，2013年与美国南佛罗里达大学缔结友好协作关系，医院荣登“全国县市级医院综合竞争力”排名第一，2011年12月，被江苏省卫生厅正式确认为三级乙等综合医院。2012年获得“全国医院（卫生）文化建设先进单位”称号。2014年成为江苏大学昆山临床医学院。