医院系昆山市中医药临床、科研医学|教育网|搜集整理、教学的中心，共有特色专科36个，其中消化内科为国家级重点中医专科在建项目，骨伤科为江苏省重点中医专科创建项目，妇科（郑氏妇科）、哮喘专病为苏州市级中医重点专（病）科，肿瘤、肝胆（微创）外科为昆山市重点专科。现有自制药品102种，剂型14种。至今共取得省、市级科研成果17项、省级科技进步奖1项、苏州市级科技进步奖10项、国家专利3项。
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