本专业培养适应我国二十一世纪社会主义现代化建设的实际需要的德、智、体、美全面发展高素质人才；具备较扎实的制药工程、生物工程、化学工程等方面基础知识，能在医药、农药、精细化工和生物化工等部门从事医药产品生产、科技开发、应用研究和经营管理的复合型高级工程技术人才，具备将新药科研成果从实验室向现实工业生产转化的实际能力，熟悉国内外医药知识产权现状，能利用专利保护我国中药发展；同时，拥有良好的文化和心理素质。
学生主要学习有机化学、物理化学、化工原理、药物化学、生物化学、毒理学、药理学、制药工艺学和制药专业设备等方面的基本理论和基本知识，受到化学、与化工实验技能，中药制药工程实验技能、工程实践、计算机应用、科学研究与工程设计方法的基本训练、具有对医药产品（特别是中成药）的生产、工艺设计、新药研制与开发、质量控制等方面能力。
开设的主要课程有：有机化学、物理化学、化工原理、化工仪表及自动化、生物化学、药物化学、药物合成反应、天然药物化学、工业药剂学、制药分离技术、药理学、制药工艺学、制药工程、药用高分子材料、中药学等。