通辽职业学院药学系的前身是通辽市卫生学校药剂专业，已有五十七年办学历史，所开设的药学专业2007年被评为自治区级品牌专业，2012年被国家教育部、财政部批准为“中央财政支持高等职业学校提升专业服务产业发展能力”建设项目。2014年成为全国药学继续教育联盟成员之一。《药理学》、《天然药物化学》、《药剂学》分别为自治区级优质精品课程和自治区级精品课程，2008年药学系被评为自治区科技创新先导型院（系），药学系党支部被评为自治区高校先进基层党支部，2011年药学专业教学团队被评为自治区级教学团队，药学系党支部被评为内蒙古自治区先进基层党组织。