北京大学药学院天然药物学系 组建于1996年12月，现由生药学研究室、天然药物化学研究室、生药学生物技术研究室、药用植物研究室和中药研究室组成。
其最早的前身是成立于1941年的中药研究所生药学部，当时由著名生药学家赵燏黄先生任生药学部主任；后来在生药学部和化学部组成的中药研究所的基础上，于1943年成立北平大学医学院药学系。1951年以后生药学领域的著名学者楼之岑先生、诚静容先生、林启寿先生等相继来我系任教，并长期担任学科带头人。楼之岑教授于1994年当选中国工程院院士。
我系是国家首批认定的生药学硕士、博士学位授权点和博士后流动站，为大学本科学生开设生药学、天然药物化学、药用植物学等课程，还设立10多门硕士及博士生课程。多年来，培养了一大批高层次人才，有些已成为科研院所、高校、生产部门的学科带头人和学术骨干。