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核心期刊：
中文核心期刊(2008)
中文核心期刊(2004)
期刊荣誉：
曾获《CAJ-CD规范》执行优秀奖；水产类期刊二等奖；全国优秀农业期刊二等奖。
上海海洋大学学报杂志社已发表论文目录：
1、奥利亚罗非鱼β-actin基因的克隆与结构分析胡海彦 贾永义 唐永凯
2、北部湾4个自然群体双线紫蛤形态差异与判别分析孙成波 刘建勇 陈?
3、牙鲆epigen基因的克隆以及在变态过程中的表达谢彩霞 邢巨斌 鲍宝龙
4、团头鲂形态发育相关基因HoxB1b的克隆及功能研究濮剑威 何珠子 邹曙明
5、奥利亚罗非鱼MSTN基因结构及其SNPs的筛选沈丽红 熊良伟 唐永凯 王帅兵
6、白斑红点鲑精子形态和超微结构的研究张永泉 尹家胜 刘奕 谷伟 许革峰 白庆利
7、基于16S rRNA技术的长江口微生物分子生物学鉴定与分析曹波 杨红 许强华 刘榕磊
8、斑鳜卵巢发育与血清蛋白磷含量变化关系的初步分析杨武 赵金良 邓燕飞 储军 黄爱平
9、马氏珠母贝4种壳色选育系F3的生长特性和遗传多样性比较陈静 刘志刚 孙小真 王辉 杜晓东
10、美洲黑石斑鱼血清IgM纯化及其兔抗血清部分特性郑磊 马振宁 吴斌 樊海平 唐凤翔 郭养浩
11、运用TRAP标记分析5个鲤群体的遗传多样性董在杰 曲疆奇 苏胜彦 梁政远 明俊超 袁新华 谢庄
12、饥饿胁迫对鲤形体、体成分及血液生理指标的影响封功能 杨文平 王爱民 李静 许杭峰 韩光明 徐跑
13、温和气单胞菌TL97528株丝氨酸蛋白酶基因片段克隆与序列分析沈锦玉 李新华 潘晓艺 尹文林 曹铮