广州中医药大学第一附属医院肛肠外科是集医疗、教学、科研为一体的综合性专科。科室具有鲜明的中医专科特色，在肛肠疾病的诊断和治疗方面均居于国内领先水平，在广东省乃至全国均具有一定的影响力。
科室位于新住院中心楼二楼，拥有宽敞的中央空调病房和优美舒适的医疗环境。技术力量雄厚，现有医生7名，其中副教授3名、主治医师4名。现有开放病床25张，每年住院人数约1000人次，门诊量约15000人次，手术约800余台次。科室诊治的疾病主要包括：结直肠良恶性肿瘤、炎症性肠病（溃疡性结肠炎、克隆氏病等）、医|学教育网搜集整理顽固性便秘、痔、复杂性肛瘘、肛裂、肛周疾病（肛周皮肤病、肛门瘙痒、肛周肿物）、各种肛门畸形（包括先天性和后天手术、外伤所致）及肛门失禁等。