desktop dna序列号|人类DNA序列TSS区域序列特征及±1核小体的位

时间:2015-01-26 15:13:25 作者:杨小希;李宏;周德良

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【摘要】:基于包含人类基因转录起始位点附近的58989条DNA序列,运用核小体特征量对序列做分类分析,发现±1核小体位于TSS区域两侧的第一类基因约占28%,TSS区域有核小体占据的第二类基因约占30%.用二阶信息冗余特征量分析了DNA序列的碱基关联分布,发现没有占据TSS区域的核小体对应的序列具有强碱基关联,占据TSS区域的核小体对应的序列具有弱碱基关联,弱关联是TSS区域的普适特征.表明占据TSS区域的核小体具有很强的序列适应性和位置的可变性.通常定义的含TSS的核小体缺失区域仅对第一类基因成立.推测第一类基因具有较高的转录效率.
【论文正文预览】:1研究背景真核生物的基因组DNA紧密缠绕在四种组蛋白八聚体上,形成珠串状的核小体(nucleosome)[1].每个核小体上缠绕着约147bp的DNA序列,相邻核小体之间的DNA含有组蛋白H1,长度约为20~54bp,被称为连接DNA(linkerDNA)[2,3].这些核小体在彼此顶部堆放形成染色质,在基因组DNA上
【文章分类号】:Q987
【稿件关键词】:转录起始区±核小体核小体特征量二阶信息冗余核小体动态变化
【参考文献】:
【稿件标题】:desktop dna序列号|人类DNA序列TSS区域序列特征及±1核小体的位置分布
【作者单位】:内蒙古大学物理科学与技术学院;
【发表期刊期数】:《内蒙古大学学报(自然科学版)》2014年06期
【期刊简介】:0......更多内蒙古大学学报(自然科学版)杂志社(http://www.400qikan.com/qk/5896/)投稿信息
【版权所有人】:杨小希;李宏;周德良;


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